АлтГУ приобрел редкий прибор для секвенирования

Полногеномный секвенатор нового поколения MinIon компании Oxford Nanopore способен расшифровать последовательность ДНК и РНК практически у любого организма. 

Южно-Сибирский ботанический сад опорного вуза приобрел данное оборудование летом 2018 года и приступил к исследовательской работе на нем с начала осени. Младший научный сотрудник Южно-Сибирского ботанического сада АлтГУ Михаил Скапцов сейчас непосредственно работает на секвенаторе в рамках сразу нескольких проектов. Так, например, он проводит полногеномное секвенирование костей древних домашних животных, найденных археологами АлтГУ в рамках проекта под руководством профессора Алексея Тишкина, в результате которого будет установлена история становления домашних пород животных.

Другой проект, поддержанный Российским фондом фундаментальных исследований совместно с Государственным фондом естественных наук Китая, исследует эволюцию двух групп древнейших растений семейства плауновых с последующим прогнозированием процессов эволюции в похожих группах растений.

«В рамках проекта "Таксономия комплекса Selaginella sanguinolenta и S. Helvetica", руководителем которого выступил директор Южно-Сибирского ботанического сада, профессор Александр Шмаков, мы исследуем микроэволюционные процессы растений и их влияние на геном. То есть мы планируем выяснить, что происходит с геномом при дивергенции видов, расхождении признаков при параллельной эволюции, – пояснил Михаил Скапцов. – С помощью секвенатора мы оцениваем влияние микроэволюционных процессов на геном растения. Данный прибор позволяет анализировать полностью геном растения, а на основе полученных данных оценить, что с ним могло произойти за сотни и тысячи лет в случаях полиплоидии, наследственных изменений, гибридизации. Соответственно, мы можем оценить сходство данных растений на уровне их геномов: какие гены включились или выключились, почему впоследствии произошло то или иное морфологическое изменение».

Кстати, методика секвенирования ДНК была использована шведским ученым Сванте Пеэбэ, основателем палеогенетики, для реконструкции ДНК, извлеченной из фрагмента кости, которая была найдена в Денисовой пещере на Алтае. В итоге ученые констатировали существование в древности ранее неизвестного вида гоминид – денисовского человека.

Ссылка на оригинал статьи